生物安全等级（biosafety level (BSL)）是指在封闭的实验室环境中隔离危险的病原体所需的一套生物安全防护措施。一般学校里都会有生物实验室，医院的验血实验室也是生物安全实验室。通常进到生物实验室里都是为了学习和研究，而按照研究对象的不同而进行分级，一共分为四级。
1级.基础实验室——一级生物安全水平基础的教学、研究 优良微生物操作技术（Good Microbiological Techniques，GMT） 不需要；开放实验台。
2级.基础实验室——二级生物安全水平初级卫生服务；诊断、研究 GMT加防护服、生物危害标志 开放实验台，此外需生物安全柜用于预防可能生成的气溶胶。
3级.防护实验室——三级生物安全水平特殊的诊断、研究 在二级生物安全防护水平上增加特殊防护服、进入制度、定向气流。BSC和／或其他所有实验室工作所需要的基本设备。
4级.最高防护实验室——四级生物安全研究水平危险病原体研究，在三级生物安全防护水平上增加气锁入口、出口淋浴、污染物品的特殊处理。 Ⅲ级BSC或Ⅱ级BSC并穿着正压服、双开门高压灭菌器（穿过墙体）、空气过滤设备。
注：BSC：生物安全柜；GMT：微生物学操作技术规范。
基础实验室——一级生物安全水平
这种类的实验室适用于已经确定不会使成年人立即感染任何疾病或是对于实验人员及实验室的人员造成最小的危险的病原体（美国疾病管制局，1997）。这类的实验室可以处理较多种类的普通病原体，例如犬传染性肝炎、非感染性的埃西里氏大肠杆菌，以及对于非传染性的病菌与组织进行培养。在这个水平中需要的用于防范生物危害的措施是微乎其微的，只需要手套和一些面部防护。不像其他种类的特殊实验室，这类的实验室并不一定需和大众交通分隔，而且在这类实验室中仅需要再开放实验台上依循微生物学操作技术规范(GMT)即可。在一般情况下，被污染的材料都留在开放（但分别注明）废弃物容器中。除此之外，这类型的实验后洗净程序与我们在现代日常生活对于微生物的大部分预防措施皆相同（例如：用抗菌肥皂洗涤一个人的手，以消毒剂清洗实验室的所有暴露表面等），但实验室环境中使用的所有细胞和/或细菌所使用的所有材料都必须经过高压釜的灭菌消毒处理。实验室人员在实验室中进行的程序中必须经由普通微生物学或相关科学训练的科学家监督且必须事先训练之。
基础实验室——二级生物安全水平
这类实验室与生物安全级别1水平类似，但其研究的病原体为对于人员和环境具有潜在危险的中度病原体。这类实验室较能处理较多种的病菌，且该病菌仅能对人类造成轻微的疾病，或者是难以在实验室环境中的气溶胶中生存，如艰难梭菌、大部分的衣原体门、A ; B与C型肝炎、A型流感、莱姆病、沙门氏菌、腮腺炎病毒、麻疹病毒、羊搔痒症、抗药性金黄色葡萄球菌与VRSA。BSL-2和BSL-1不同之处在于：
1.实验人员与处理病原体人员需为特定培训和高级培训的科学家
2.实验时限制特定人士的出入
3采取极端的防治污染物品预防措施; 需要生物安全柜或其他物理遏制设备
4.从可能产生造成传染性气融胶或喷雾的实验必须在二级生物安全柜进行。
防护实验室——三级生物安全水平
该级别实验室适用于临床、诊断、教学、科研、或生产药物，这类实验室专门处理本地或外来的病原体且这些病原体可能会藉由吸入而导致严重的或潜在的致命疾病。这些病原体包括目前已经有治疗法但可能导致人类患严重的致命性疾病的各种细菌、寄生虫和病毒，包括但不局限于炭疽杆菌、结核杆菌、利什曼原虫、鹦鹉热衣原体、西尼罗河病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、东部马脑炎病毒、SARS冠状病毒、伤寒杆菌、贝纳氏立克次体、裂谷热病毒、立克次氏体与黄热病毒。
实验室工作人员必须接受有关致病性和潜在的致命或致病性病原体的具体培训，且必须被对于此方面有经验之适任科学家监督。这被认为是中性或暖区（neutral or warm zone）。
所有涉及感染性材料的操作过程是在生物安全柜，专门设计的通风柜内进行，或由备有其他物理抑制装置/穿着适当的个人防护衣物和设备的人员进行操作。该实验室具有特殊的工程和设计特点。
虽然上述配备是被公认为必须设施，然而，一些现有的设施可能没有都符合生物安全3级的（例如：双门进入区和密封零渗透力配备（sealed penetrations））建议。在这种情况下，在可供接受的安全水平下进行例行程序的行为（例如：涉及鉴定病原体与人传播的诊断程序、分类，药物过敏试验等），可在生物安全2级（P2）设施中实施提供，例如：
1.将从实验室里过滤后的废气排放到室外
2.实验室的通风平衡提供定向气流进入室内
3.在工作正在进行时限制进入实验室的人士
4.严格遵循推荐的标准微生物的实践与特别的做法，并配有生物安全3级安全设备
但实施这一生物安全水平3建议修改的决定只能由实验室主任批准。
最高防护实验室——四级生物安全水平
此级别需要处理危险且未知的病原体，且该病原体可能造成经由气溶胶传播之病原体或造成高度个人风险，且该病原体至今仍无任何已知的疫苗或治疗方式，如阿根廷出血热与刚果出血热、伊波拉病毒、马尔堡病毒、拉萨热、克里米亚-刚果出血热、天花，以及其他各种出血性疾病。当处理这类生物危害病原体时，实验人员需强制性地穿戴独立供氧的正压防护衣。生物实验室的四个出入口将配置多个淋浴设备。同时有真空室与紫外线光室，及其他旨在摧毁所有的生物危害的痕迹之安全防范措施。同时，所有出入口都为气密式，并且被以电脑控制上锁，以防止在同一时间打开两个门。所有的废气及废水的排放，均使用生物安全4级（或P4）实验室进行类似的消毒程序，以减少意外释放的可能性。
当一个病原体被怀疑或可能有抗药性时都必须在BSL-4实验室进行处理，直到有足够的数据确认前，都必须在该等级之实验室持续工作。实验人员必须对于他们在处理极其危险的传染性有具体和深入的培训，同时理解严格的标准、特殊的措施、防护配备及工作目标。他们会被与受过训练或曾实际处理这些病原体的合格科学家监督。且实验室的出入受到实验室主任的严格控制。四级生物安全实验室是在一个单独的建筑物或在控制区域内的建筑物，同时与该区域内其他建筑物完全隔离。且该实验室必须建立防止污染的计画，需要经常使用负加压设备并准备或采用一个特定设备操作手册。如此一来即使实验室受到损害，也能抑制透过气胶传播之病原体在环境中的爆发。而实验室内的所有实验活动只限于在III级生物安全柜中进行，或II级生物安全柜，且只有装备生命支持系统及通过正压通风的实验者才能使用。